腸腦軸線(gut-brain axis)是消化道與中樞神經系統間雙向溝通的生物化學路徑，而微菌叢(microbiota)，特別指的是腸道微菌叢，可以藉由調節免疫系統及分泌相關因子例如短鏈脂肪酸(shortchain fatty acid, SCFA)，來進一步調節大腦功能與認知行為，因此延伸出「微菌叢-腸-腦軸線」(microbiota -gut-brain axis)這個名詞來描述腸道菌種在此交互作用間的角色^[1,2]。有越來越多的研究顯示腸道微菌叢與老化、神經退化性疾病、腸胃道疾病及食慾調控有關；而益生菌(probiotics)與益菌生(prebiotics)對於壓力調節、腸胃道疾病及體重管理的角色也越來越被重視^[1-4]，因此本文目的為探討「微菌叢-腸-腦軸線」的相關機轉及可能與此軸線相關的疾病，並介紹影響腸道微菌叢之因素及目前的治療策略。